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四倍体马铃薯重要遗传性状的关联分析

 四倍体马铃薯重要遗传性状的关联分析

 

1. 西南马铃薯品种的遗传多样性研究

    基于SSR群体结构分析将169份马铃薯核心资源划分为3个类群,欧洲材料和西南地区品种主要分为两类,其中I类群中有44%的欧洲材料和43%的西南品种,II类群中主要包括50%的欧洲材料和54%的西南品种。III类群中以地方品种和CIP资源为主,地方品种占55%CIP资源全部属于III类。


1 西南马铃薯品种与欧美品种的亲缘关系

    应用SSR分子标记技术对“云薯”系列品种及参照品种进行遗传多样性分析。聚类分析结果表明,在相似系数0.63处,参试品种分为两类,第Ⅰ类为主要为云薯系列品种,第Ⅱ类主要为北方品种、西南地区品种。


2 西南马铃薯品种的聚类分析

 

2. 四倍体马铃薯重要遗传性状的关联分析

    利用四倍体马铃薯开展GWAS分析,开展对778份资源进行晚疫病抗性、生育期、株高、单株重、单株结薯数农艺性状评价。

    本项目共获得6,162.86Mreads数据,测序平均Q3093.30%,平均GC含量为39.51%。通过生物信息学分析,共获得1,198,928SLAF标签,样本SLAF标签的平均测序深度为17.05x,其中多态性SLAF标签有1,032,778个,共获得16,531,339SNP标记。


3  778份四倍体马铃薯品种的GWAS分析

 

3. 马铃薯基因组变异数据库的构建

3.1.开发与抗晚疫病紧密连锁的实用分子标记;利用抗晚疫病分子标记辅助选择技术进行品种筛选和种质创制。

3.2. 针对已经报道的马铃薯加工品质性状相关的基因与紧密连锁标记,主要包括马铃薯薯形、还原糖含量和油炸色泽等性状,研发简单易操作、低成本、准确度高的分子标记以及多分子标检测体系。


4马铃薯基因组变异数据库

 

注: 马铃薯基因组变异数据库受到国家自然科学基金“四倍体马铃薯SNP遗传图谱的构建及重要农艺性状的关联分析”(31460368)、国家马铃薯产业技术体系(CARS-09-P03)、国家重点研发计划(2017YFD0101906)等项目资助